我校除了设立
学科竞赛班、东大基地班
这些特长生培养的固定班型之外，
还打破行政班，
通过成立“虚拟菁英班”
（以下简称菁英班），
整合校内外资源，
加强对优生的培养。
张士民校长、南京大学原招办主任赵鸣老师为2021届菁英班揭牌
学校在每个年级均会选拔包括学科特长生在内的优秀学生成立菁英班，整合高中部的优质教育教学资源，挑选优秀教师为菁英班学生开设专题讲座、短课程等，邀请包括南师附中本部在内的校外优秀教师为菁英班学生开设学科讲座。自菁英班成立以来，我校校长张士民老师，江苏省高考语文阅卷专家雷雨老师，南京师大附中优秀的语文、数学、英语学科教师等走进了菁英班，他们开拓了学生的视野，提高了学生的认知，使学生有了更多的收获。
邀请本部英语老师为菁英班开设英语学习讲座
邀请本部语文老师为菁英班开展作文写作教学
邀请本部数学奥赛教练为菁英班进行数学学习指导
学校不定期邀请本校毕业的优秀校友们和菁英班的学生交流，以此拓展他们的视野，提升他们的思维。此外，学校还充分利用东南大学优质教育资源，邀请东南大学的教授和优秀学长为菁英班学生开设讲座、规划高中学业、分享学习心得和心理调适方法等。
近年来，学校在菁英班学生的培养方面取得了突出的成绩！
2018年，高二13位菁英班同学参加高考，全部达本科线，其中9人超本一线，高二10班杨佳希同学被中科大少年班录取。
2019年，高二年级12位菁英班同学参加高考，全部达本一线，其中380人以上4人，孔冰清同学取得392分的好成绩。
2020年，高二年级7位菁英班同学参加高考，6人达本一线，欧阳珅同学取得396分的好成绩。
2021年，高二年级15位菁英班同学参加高考，全部达本一线，赵乐鹏同学取得633分的好成绩。
菁英班课程为学科特长生们打开了另一扇窗户，它让同学们懂得，要成为一名优秀的高中生，需要的不仅仅是书本上的知识，还应该有宽广的视野、思辨的能力、规划的意识和一颗不断追求卓越的心。相信在菁英班里，优秀的你能够成长为最好的自己！