上海市西南位育中学国际部的课程设置采用一个学年两个学期的结构，学生每个学年可获得八个学分。除核心科目(英美文学、数学、自然科学、社会学和中国国家课程)外，还提供学术选修课程和 AP 课程。
英美文学课程：
含世界文学、美国文学和英国文学三门核心课程。英美文学课程让学生接触大量的文学小说、短篇故事、诗歌、戏剧、散文等。学生通过独立阅读、文章分析、小组讨论或辩论等形式来赏析文学作品。
数学课程：
含代数、进阶代数、预备微积分和微积分等核心课程。数学课程的教学有成熟的分级和层次，教授学生在高中阶段所必需的数学知识，并帮助学生为标准化数学考试做好准备。除课本内容外，数学课程在教学中鼓励学生使用软件学习方式，如Desmos, Microsoft excel, Geogbra等，培养学生创新思维和数字处理能力。
自然科学课程：
含生物、化学、物理和科学等学科。生物学主要授课内容为细胞的生态学、进化、遗传学和生物化学。化学课程内容是对物质结构的全面介绍。物理学则涵盖牛顿力学、功、能量和功率等主题。自然科学课程以实验操作为基础，鼓励学生参与研究，使学生掌握科学领域中一般的概念、原理和法则，正确运用科学方法，探索解决现实问题的方法。
社会学课程：
含世界历史、美国历史、心理学和经济学等学科，社会科课程除日常教学外，还会组织并引导学生对一些社会热点问题进行调查和研究。旨在拓宽学生的思维维度，提升批判性思维能力，并增强学生的自我认知。
中国国家课程：
依据沪教委基委(2013)37号文件要求开设语文、政治、历史和地理四门国家必修课程。教学除基于《上海市学业水平合格性考试》的要求，还指导学生以课题为抓手进行融合项目的研究。